多重PCR技術用於食源性金黃色葡萄球菌腸毒素的檢測

2017-08-24 11:12:13 來源: 世界杯赛程预测 導刊

  金黃色葡萄球菌是造成食物中毒、化膿性疾病的常見菌種,在土壤、空氣、水源中均有廣泛分布,由於汙染食物的概率大,因此成為一項公共衛生問題。就目前而言,已知的腸毒素種類包括19種,由於缺少特異檢測手段,尚且不能明確食物中毒的機製。基於此,本文選取145株金黃色葡萄球菌進行研究,探討了多重PCR檢測技術的應用效果。

  材料與方法

  菌株來源 145株金黃色葡萄球菌從食物檢測樣本中提取,其中食源性致病菌檢測樣本110株,包括熟肉、速凍製品、涼拌菜、沙拉、果汁等;食物中毒樣本35株,從患者剩餘食物、糞便、肛拭子中獲得。

  儀器試劑 Baird-Parker瓊脂培養基、血平板、亞碲酸鉀卵黃增菌液,均由北京陸橋技術股份有限公司提供;溶菌酶、基因組提取試劑盒、PCR引物,由上海生工生物工程公司提供;細菌培養箱是由德國賓德公司提供;基因擴增儀、毛細管電泳儀、微量分光光度計等,是由美國IBM公司提供。

  方法 菌株複蘇:在菌株磁珠凍存管中,用接種環挑取1顆磁珠,放於營養瓊脂肉湯中,在37℃溫度下培養24小時,並觀察其渾濁度。基因提取:取混濁菌液1ml放在1.5ml的EP管內,10000rpm離心3min。除去上層清液,向沉澱物加入200μl溶菌酶溶液(濃度為50mg/ml),混合均勻後,在37℃條件下靜置1小時。然後按照DNA提取試劑盒上的說明提取DNA,用微量分光光度計,測定提取DNA的濃度,加純水直至濃度達到10ng/μl,並保存在-20℃的環境中。引物設計和片段測序:參考GenBank數據庫、應用Primer remier分析軟件,分別對9種腸毒素基因的PCR引物進行篩選和設計,見下表1。


  單重PCR反應體係:Multiplex PCR Mix2 25μl,上遊引物、下遊引物均為0.5μl;Multiplex PCR Mix1 0.25μl,模板4μl,加入純水直至50μl。擴增條件:94℃條件下預熱2min,94℃30s、54℃60s、72℃80s,共計35個循環;最後72℃延伸8min。經毛細管電泳處理後,對PCR產物進行測序。多重PCR反應體係:對退火溫度、引物濃度等進行調節,優化單重PCR反應體係如下:Multiplex PCR Mix2 25μl,上遊引物、下遊引物均為0.4μl;Multiplex PCR Mix1 0.25μl,模板4μl,加入純水直至50μl。擴增條件設置如下:94℃條件下預熱2min;然後分別94℃30s、50℃60s、72℃80s,經過35個循環;最後72℃條件下延伸8min。對PCR產物進行毛細管電泳處理,觀察結果。

  結果

  引物特征性驗證結果。采用盲篩法,選擇9株毛細管電泳結果出現的目的片段菌株,對PCR產物測序後,和GenBank數據庫進行比對。結果顯示產物片段相似度高,滿足研究需求。見表2。

 

  多重PCR檢測結果。利用多重PCR體係,對145株金黃色葡萄球菌的腸毒素基因進行檢測,結果顯示97株(66.9%)至少含有1種腸毒素基因,48株(33.1%)含有2種及以上腸毒素基因。其中,9種腸毒素基因的檢出率從高到低依次為:SEU37株(25.5%)、SEG32株(22.1%)、SEM30株(20.7%)、SEK29株(20.0%)、SEQ26株(17.9%)、SEH23株(15.8%)、SEN15株(10.3%)、SEJ12株(8.3%)、SEL6株(4.1%)。金黃色葡萄球菌屬於葡萄球菌的一種,是造成食物中毒的重要原因之一,美國疾控中心的調查數據顯示,該菌株造成的食物中毒占比約為33%,僅次於大腸埃希氏菌,位居第二。對金葡的研究發現,其包含多種致病因子,例如腸毒素、殺白細胞素、溶血素、血漿凝固酶等,其中腸毒素的作用最為明顯。腸毒素是低分子蛋白和多肽,具有較強的耐熱性,即使在70-80℃條件下,30min以內蛋白不會完全破壞,而且也不會被胰蛋白酶降解。針對已知的腸毒素種類,采用有效的、特異檢測手段,能明確食物中毒的發生機製,為臨床診療提供依據。

  本次研究中,以SEG、SHE、SEJ、SEK、SEL、SEM、SEN、SEQ、SEU 9種腸毒素為研究對象,建立了多重PCR檢測體係,具有操作簡單、通量高、特異性高的優點。結果顯示,9種腸毒素均有檢出,以SEU、SEG、SEM、SEK的檢出率高。另外,相關研究指出,SEK和SEQ之間,SEM和SEN之間,SEG和SEU之間,均存在連鎖關係。以SEK和SEQ為例,兩者位於同一株金葡菌上,可能會對金葡菌的毒性力度產生影響,有待進一步研究。

  綜上,多重PCR技術用於食源性金黃色葡萄球菌腸毒素基因檢測,準確性和特異性高,具有良好的應用價值。

  高利海 精益和泰質量檢測股份有限公司

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